論英語(yǔ)科技論文的技巧

時(shí)間:2022-04-21 09:10:00

導(dǎo)語(yǔ):論英語(yǔ)科技論文的技巧一文來(lái)源于網(wǎng)友上傳,不代表本站觀點(diǎn),若需要原創(chuàng)文章可咨詢客服老師,歡迎參考。

論英語(yǔ)科技論文的技巧

前言

我的第一篇英語(yǔ)科技論文寫作是把在科大的學(xué)士畢業(yè)論文翻譯成英文。當(dāng)我一九九零年從紐約州立大學(xué)博士畢業(yè)時(shí),發(fā)表了20多篇英語(yǔ)論文。但是,我對(duì)怎樣寫高質(zhì)量科技論文的理解仍舊處于初級(jí)階段,僅知道盡量減少語(yǔ)法錯(cuò)誤。這是因?yàn)榇蠖鄶?shù)時(shí)間我都欣然接受我的博士指導(dǎo)老師Dr.GeorgeStell和Dr.HaroldFriedman的修改,而不知道為什么要那樣改,也沒(méi)有主動(dòng)去問(wèn)。這種情況一直持續(xù)到我去北卡州立大學(xué)做博士后。我的博士后指導(dǎo)老師Dr.CarolHall建議我到鄰近的杜克大學(xué)去參加一個(gè)為期兩天的寫作短訓(xùn)班。這堂由Gopen教授主辦的短訓(xùn)班真使我茅塞頓開。第一次,我知道了讀者在閱讀中有他們的期望,要想寫好科技論文,最有效的方法是要迎合他們的期望。這堂寫作課幫我成功地完成了我的第一個(gè)博士后基金申請(qǐng),有機(jī)會(huì)進(jìn)入哈佛大學(xué)Dr.MartinKarplus組。在哈佛大學(xué)的五年期間,在Karplus教授的指導(dǎo)下,我認(rèn)識(shí)到一篇好的論文需要從深度廣度進(jìn)行里里外外自我審查。目前,我自己當(dāng)了教授,有了自己的科研組,也常常審稿。我覺(jué)得有必要讓我的博士生和博士后學(xué)好寫作。我不認(rèn)為我自己是寫作專家。我的論文也常常因?yàn)檫@樣或那樣的原因被退稿。但是我認(rèn)為和大家共享我對(duì)寫作的理解和我寫作的經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn),也許大家會(huì)少走一些我走過(guò)的彎路。由于多年未用中文寫作,請(qǐng)大家多多指正。

導(dǎo)言

通常來(lái)講,研究生和博士后從他的導(dǎo)師那兒得到研究方向。經(jīng)過(guò)多次反復(fù)試驗(yàn),得到一些好的結(jié)果。接下來(lái)他們需要對(duì)得到的數(shù)據(jù)進(jìn)行總結(jié)和分析,寫成論文。一篇精寫的論文更容易被高檔雜志接受。而寫得不好的論文很可能被退稿。論文的數(shù)量和質(zhì)量是學(xué)生和導(dǎo)師事業(yè)發(fā)展的敲門磚。不成文,便成仁,是學(xué)術(shù)生涯的寫照。

很多學(xué)生以為當(dāng)結(jié)果到手的時(shí)候研究就結(jié)束了。他們寫的草稿,常常把原始數(shù)據(jù)放在一起,沒(méi)有對(duì)方法和數(shù)據(jù)進(jìn)行詳細(xì)分析,沒(méi)有對(duì)當(dāng)今論文的評(píng)述。事實(shí)上,寫作是研究不可分割的一部分。此刻是弄懂方法的成功與失敗,尋找結(jié)果的解釋及其隱含的意義,以及與其他相關(guān)研究進(jìn)行比較的時(shí)候。

我們?yōu)槭裁葱枰趯懽魃先绱苏J(rèn)真努力?原因很簡(jiǎn)單。一個(gè)研究結(jié)果只有在被別人使用時(shí)才有意義。而想被別人使用,文章必須能引起其他科學(xué)家的興趣,而且得保證其他人能看懂并可以重復(fù)和再現(xiàn)你的結(jié)果。只有可以被理解的研究才會(huì)被重復(fù),也只有可以被再現(xiàn)的工作才能導(dǎo)致別人的引用和跟蹤。而你的論文被引用的數(shù)量常常用來(lái)衡量研究的影響力。從某種角度看,寫作就像是把你的工作成果推銷給其他的科學(xué)家。

為了更好的推銷,科學(xué)論文必須滿足它獨(dú)特的顧客:由聰明能干的科學(xué)家組成的尖端讀者。它必須能先說(shuō)服(通常也是競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手的)同行們,因?yàn)樗麄兊脑u(píng)審是文章在發(fā)表前的第一道關(guān)口。同時(shí),它也必須滿足一般讀者的要求。為了達(dá)到這個(gè)目標(biāo),我們首先要理解他們需要什么?

讀者需要什么?

你的文章的潛在讀者可能有剛進(jìn)入這領(lǐng)域的新手:大學(xué)生和研究生,也有專家(潛在審稿人)。他們對(duì)你的領(lǐng)域會(huì)有不同程度的了解。因此,寫文章的時(shí)候應(yīng)該力求簡(jiǎn)單到可以被新手理解,同時(shí)深刻到可以引起專家的興趣。

所有的科學(xué)家(不論是學(xué)生還是他們的導(dǎo)師)往往都很忙。大量期刊雜志使他們不可能仔細(xì)閱讀每一篇論文。他們通常希望能在最短時(shí)間內(nèi)找到文章最重要的信息。典型的情況是如果文章標(biāo)題不吸引人,他們或許就會(huì)跳過(guò)這篇論文。如果文章的摘要沒(méi)有包含重要的新方法或新結(jié)果,他們不會(huì)去讀這篇文章。即使已經(jīng)決定要讀的論文,他們也會(huì)跳過(guò)很多段落直接去找自己最感興趣的地方。因此,保證文章的結(jié)構(gòu)能使讀者很快找到所需的信息非常重要。文章的關(guān)鍵在于結(jié)構(gòu),不在于語(yǔ)法。語(yǔ)法錯(cuò)誤易改,結(jié)構(gòu)錯(cuò)誤則往往讓人無(wú)從下手,不知所云。我審過(guò)一些國(guó)內(nèi)同行的論文,結(jié)構(gòu)問(wèn)題很常見(jiàn)。

總之,一篇文章只有在不需太多努力就可以理解的情況下才會(huì)被廣泛地引用。文章清晰的關(guān)鍵就是使讀者能在他們想找的地方找到他們需要的東西。這也就是說(shuō),要想讓讀者不費(fèi)力理解你的論文,你必須費(fèi)力去滿足他們的期望。

讀者期望什么?

讀者對(duì)句子的期望

1.讀者希望在句子的開始看到熟悉的信息。句子是文章的最小功能單元。最容易理解的句子是整句都在說(shuō)讀者知道的東西。但這對(duì)科技論文是不可能的,因?yàn)橹挥行碌臇|西才會(huì)被發(fā)表。事實(shí)上科技論文通常會(huì)包含很多新術(shù)語(yǔ),所以一個(gè)容易理解的句子應(yīng)該從讀者熟悉的信息(或剛剛提過(guò)的)開始而以新信息結(jié)束,并在它們之間平滑地過(guò)渡。好文章的所有句子都應(yīng)該這樣從舊到新地平滑過(guò)渡。寫好一句開頭的金科玉律是問(wèn)問(wèn)你自己:“我以前有沒(méi)有提過(guò)這個(gè)概念?”大多數(shù)文章很難讀是因?yàn)楹芏嘈赂拍钤跊](méi)有被介紹之前就使用了。例如:

Samplesforthe2-dimensionalprojectionofkinetictrajectoriesareshowninFigure7.Thecoilstatesarelooselygatheredwhilethenativestatescanformablackclusterwithextremelyhighdensityinthe2-dimensionalprojectionplane.

這里從第一句到第二句信息無(wú)法流動(dòng)。“Thecoilstates”不知道是從何而來(lái)的。讀者會(huì)發(fā)現(xiàn)下面改動(dòng)后的句子更容易明白。

KinetictrajectoriesareprojectedontoxxandyyvariablesinFigure7.Thisfigureshowstwopopulatedstates.Onecorrespondstolooselygatheredcoilstateswhiletheotheristhenativestatewithahigherdensity.

在這個(gè)新段里,新插入的第二句使每句均能從舊信息出發(fā)到新信息結(jié)束。第一句與第二句之間以“Figure”相連而第二句與第三句之間以“twostates”相連。而新信息“coilstates”則出現(xiàn)在第三句的最后。整段環(huán)環(huán)相連,成為一個(gè)整體。再看一個(gè)例子:

TheaccuracyofthemodelstructuresisgivenbyTM-score.Incaseofaperfectmatchtotheexperimentalstructure,TM-scorewouldbe1.

在第二個(gè)句子里,舊信息“TM-score”被埋在中間,被新信息“aperfectmatchtoexperimentalstructure”打斷了。這里建議修改如下:

TheaccuracyofthemodelstructuresismeasuredbyTM-score,whichisequalto1ifthereisaperfectmatchtotheexperimentalstructure.

科技寫作中的最大問(wèn)題就是新舊信息順序顛倒。新信息和舊信息對(duì)作者來(lái)說(shuō)可能不是很好區(qū)分,因?yàn)樗浅J煜に械男畔ⅰ榱吮苊膺@種問(wèn)題,不管什么時(shí)候,每當(dāng)你開始寫新句,你應(yīng)該問(wèn)問(wèn)自己,這些詞前面有沒(méi)有被提到過(guò)。一定要把提到過(guò)的放前面,沒(méi)提過(guò)的放后面。

2.讀者想在主語(yǔ)之后立刻看到行為動(dòng)詞。對(duì)一個(gè)說(shuō)明誰(shuí)在做什么的句子,讀者需要找到動(dòng)詞才能理解。如果動(dòng)詞和主語(yǔ)之間相隔太遠(yuǎn),閱讀就會(huì)被尋找動(dòng)詞打斷。而打斷閱讀就會(huì)使句子難以理解。這里有個(gè)例子:[1]

ThesmallestURFs(URFA6L),a207-nucleotide(nt)readingframeoverlappingoutofphasetheNH2-terminalportionoftheadenosinetriphosphatase(ATPase)subinit6genehasbeenidentifiedastheanimalequivalentoftherecentlydiscoveredyeastH+-ATPasesubunit8gene.

同樣的句子,將動(dòng)詞放在主語(yǔ)之后:[1]

ThesmallestoftheURFsisURFA6L,a207-nucleotide(nt)readingframeoverlappingoutofphasetheNH2-terminalportionoftheadenosinetriphosphatase(ATPase)subinit6Gene;ithasbeenidentifiedastheanimalequivalentoftherecentlydiscoveredyeastH+-ATPasesubunit8gene.

這樣新的句子就更加平衡了。盡量避免過(guò)長(zhǎng)的主語(yǔ)和過(guò)短的賓語(yǔ)。這就像頭重腳輕的人很難站穩(wěn)。短的主語(yǔ)緊跟著動(dòng)詞加上長(zhǎng)的賓語(yǔ)效果會(huì)更好。

3.讀者期望每句只有一個(gè)重點(diǎn),這個(gè)重點(diǎn)通常在句尾。比較下面兩個(gè)句子,我們可以感覺(jué)到他們著重強(qiáng)調(diào)不同的東西。[1]

URFA6LhasbeenidentifiedastheanimalequivalentoftherecentlydiscoveredyeastH+-ATPasesubunit8gene.

RecentlydiscoveredyeastH+-ATPasesubunit8genehasacorrespondinganimalequivalentgeneURFA6L.

很明顯,前面的句子是關(guān)于一個(gè)最近發(fā)現(xiàn)的酵母基因,而第二句則著重強(qiáng)調(diào)了它有一個(gè)和動(dòng)物一致的基因。另外一個(gè)例子:[1]

Theenthalpyofhydrogenbondformationbetweenthenucleosidebases2-deoxyguanosine(dG)and2-deoxycytidine(dC)hasbeendeterminedbydirectmeasurement.

這個(gè)句子看起來(lái)好像是在強(qiáng)調(diào)“directmeasurement”。這不太像是原作者的目的。顛倒一下會(huì)使句子更加平衡。[1]

Wehavedirectlymeasuredtheenthalpyofhydrogenbondformationbetweenthenucleosidebases2-deoxyguanosine(dG)and2-deoxycytidine(dC).

新的句子更簡(jiǎn)單而且更短,同時(shí)避免了頭重腳輕的癥狀。總之,句尾是讀者對(duì)該句最后的印象。把最好的,最重要的,和想要讀者記住的東西放在句尾。

讀者對(duì)段落的期望

每一個(gè)段落都應(yīng)該只講一個(gè)故事。在一段里表述多個(gè)觀點(diǎn)會(huì)使讀者很難知道該記住什么、這段想表達(dá)什么。一段的第一句要告訴讀者這一段是講什么的。這樣讀者想跳過(guò)這段就可以跳過(guò)。一段的最后一句應(yīng)該是這段的結(jié)論或者告訴讀者下一段是什么。段落中的句子應(yīng)該由始到終通過(guò)邏輯關(guān)系連接,實(shí)現(xiàn)由舊信息到新信息的流動(dòng)。比如這一段:[1]

Theenthalpyofhydrogenbondformationbetweenthenucleosidebases2-deoxyguanosine(dG)and2-deoxycytidine(dC)hasbeendeterminedbydirectmeasurement.dGanddCwerederivatizedatthe5and3hydroxylswithtriisopropylsilylgroupstoobtainsolubilityofthenucleosidesinnon-aqueoussolventsandtopreventtheribosehydroxylsfromforminghydrogenbonds.Fromisoperibolictitrationmeasurements,theenthalpyofdC:dGbasepairformationis-6.650.32kcal/mol.

很難知道作者在這段里想表達(dá)什么。從這段的起始和結(jié)束看來(lái),焓(enthalpy)應(yīng)該是他想表達(dá)的重點(diǎn)。下面是重新組合后的段落。[1]

Wehavedirectlymeasuredtheenthalpyofhydrogenbondformationbetweenthenucleosidebases2-deoxyguanosine(dG)and2-deoxycytidine(dC).dGanddCwerederivatizedatthe5and3hydroxylswithtriisopropylsilylgroups;thesegroupsservebothtosolubilizethenucleosidesinnon-aqueoussolventsandtopreventtheribosehydroxylsfromforminghydrogenbonds.TheenthalpyofdC:dGbasepairformationis-6.650.32kcal/molaccordingtoisoperibolictitrationmeasurements,

首句描述了整段的主題。原段里的第一句顛倒是為了1)使新信息“dG”和“dC”在句子最后并強(qiáng)調(diào)它們。2)更好地跟下面一句銜接。原段里的第二句被分成兩部分,這樣每一部分只表達(dá)了一個(gè)觀點(diǎn)。最后一句時(shí)總結(jié)整段。再看另一個(gè)例子:[1]

Largeearthquakesalongagivenfaultsegmentdonotoccuratrandomintervalsbecauseittakestimetoaccumulatethestrainenergyfortherupture.Theratesatwhichtectonicplatesmoveandaccumulatestrainattheirboundariesareapproximatelyuniform.Therefore,infirstapproximation,onemayexpectthatlargerupturesofthesamefaultsegmentwilloccuratapproximatelyconstanttimeintervals.Ifsubsequentmainshockshavedifferentamountsofslipacrossthefault,thentherecurrencetimemayvary,andthebasicideaofperiodicmainshocksmustbemodified.

在這個(gè)例子里,前兩句共同闡明了積累張力的速度(RateOfStrainAccumulation)。然而,第一句里的舊信息并沒(méi)有放在第二句的開始。讀者讀到第三句的時(shí)候通常就不明白這段到底要講什么了。更清晰的描述應(yīng)該如下:[1]

Largeearthquakesalongagivenfaultsegmentdonotoccuratrandomintervalsbecauseittakestimetoaccumulatethestrainenergyfortherupture.Theratesofstrainaccumulationattheboundariesoftectonicplatesareapproximatelyuniform.Therefore,nearlyconstanttimeintervals(atfirstapproximation)wouldbeexpectedbetweenlargerupturesofthesamefaultsegment.[However?],therecurrencetimemayvary;thebasicideaofperiodicmainshocksmayneedtobemodifiedifsubsequentmainshockshavedifferentamountsofslipacrossthefault.

新段現(xiàn)在著重闡明了地震的發(fā)生頻率。下劃線標(biāo)明了以前描述過(guò)的舊信息。很明顯,新舊信息的連接是理解這段的關(guān)鍵。從舊信息到新信息的流動(dòng)是使讀者輕松閱讀的最佳方式。寫文章的目的不是去測(cè)試讀者的閱讀能力,而是考驗(yàn)作者的表達(dá)能力。不能怪人沒(méi)看懂,只能怪自己沒(méi)寫清楚。常常聽(tīng)到這樣的抱怨:那審稿人連這都不懂!審稿人也可以說(shuō):連這個(gè)也寫不清楚。

讀者對(duì)圖表的期望一些沒(méi)有耐心的讀者會(huì)直接通過(guò)圖表來(lái)判斷一篇文章是否值得一讀。怎樣能使讀者不需讀正文就能理解圖表是至關(guān)重要的。

對(duì)于表來(lái)說(shuō),由于我們是從左向右閱讀的,我們熟悉的信息應(yīng)該出現(xiàn)在左邊而新的信息出現(xiàn)在右邊。例如,下面列出的表1和表2是僅僅調(diào)換了兩列。比較一下那個(gè)表格更易理解。

表1:[1]

表2:[1]

顯然因?yàn)槲覀兏煜r(shí)間作為獨(dú)立變量,表2就比表1容易讀些。制表的另一條規(guī)則是把最好的留在最后。也就是最能使人感興趣的結(jié)果應(yīng)該放在最右邊一列或在最后一行,因?yàn)檫@些地方是讀者結(jié)束閱讀并能留下印象的地方。下面的例子比較了各種方法的精度。最后一行展示了現(xiàn)在得到的結(jié)果。

表3:

對(duì)于圖,我們至少應(yīng)該對(duì)所有的標(biāo)簽(數(shù)字、座標(biāo)和說(shuō)明)使用大的黑體Helvetica字體。只畫出重要的區(qū)域。盡量不用彩色就能使曲線達(dá)到最大的區(qū)分(彩色的圖很貴)。[2]

這是我喜歡的一個(gè)圖。它說(shuō)明了一些畫圖的原理。對(duì)你的工作用實(shí)線而對(duì)別人的工作用點(diǎn)畫線。間隔使用實(shí)心和空心符號(hào)來(lái)使曲線之間的不同更加明確。詳細(xì)說(shuō)明X和Y座標(biāo),標(biāo)題不用縮寫。

審稿人要什么?

文章在發(fā)表前必須經(jīng)過(guò)審稿人的評(píng)審。他們一般是相關(guān)領(lǐng)域的專家甚至是你的競(jìng)爭(zhēng)者。他們會(huì)盡力尋找你文章中的毛病。有時(shí),由于不同的觀點(diǎn)和競(jìng)爭(zhēng)的需要,審稿人或許會(huì)試圖阻止你的文章發(fā)表。因此,文章必須寫得理由充足。在被別人挑剔之前,自己必須首先雞蛋里挑骨頭,預(yù)先回答審稿人的可能質(zhì)疑。

怎樣滿足審稿人?

1).只提出“一”個(gè)中心命題。論文里的觀點(diǎn)太多,不但不好寫,問(wèn)題也容易多,讀者也不易記住你要說(shuō)什么。

2).在這個(gè)中心命題的基礎(chǔ)上,用一個(gè)迷人(但絕不夸張)的標(biāo)題來(lái)吸引審稿人的興趣。無(wú)償審稿使審稿人只審批感興趣的論文。如果你不能引起審稿人的興趣,那最好不要發(fā)表那篇文章。編輯們有時(shí)候會(huì)很郁悶,因?yàn)檎也坏接信d趣的審稿人。

3).合理解釋每一個(gè)參數(shù),合理說(shuō)明每一個(gè)步驟。審稿人沒(méi)時(shí)間考慮細(xì)節(jié)。程序和參數(shù)的合理化顯示出你知道你在做什么,而不是湊數(shù)據(jù)。沒(méi)理由要找理由,有理由要強(qiáng)調(diào)。

4).問(wèn)問(wèn)你自己是否提供了足夠重復(fù)你工作的所有細(xì)節(jié)。審稿人(或讀者)越容易再現(xiàn)你的工作,他就越可能接受你的文章。當(dāng)然,審稿人并不會(huì)真正去重做你的工作,但你必須通過(guò)你的描述使他相信可以重做。

5).必須有說(shuō)服力!盡量做徹底而不是半成品的工作!用多方面測(cè)試來(lái)證明你的中心命題。要使文章像律師證明無(wú)罪官司,預(yù)先回答一切可能提出的疑問(wèn)。

6).引用所有重要的研究工作,特別是經(jīng)典力作。寫作的時(shí)候要再做全面文獻(xiàn)檢索。

為了達(dá)到這些目標(biāo),寫科學(xué)論文的時(shí)候必須遵照一定的框架結(jié)構(gòu)。

文章的結(jié)構(gòu)

典型的科學(xué)論文包括標(biāo)題、摘要、引言、方法/實(shí)驗(yàn)步驟、結(jié)果、討論、致謝,和參考文獻(xiàn)。這樣的結(jié)構(gòu)是用來(lái)幫助讀者快速找到他們感興趣的信息。把信息放錯(cuò)地方會(huì)使讀者糊涂。常犯的錯(cuò)誤是混淆事實(shí)(結(jié)果)和解釋(討論)。討論是對(duì)結(jié)果的解釋及說(shuō)明它的意義,而不是重復(fù)結(jié)果的描述。

一篇論文是從摘要,引言開始,這里建議從方法和結(jié)果部分開始寫,因?yàn)槟銓?duì)方法和結(jié)果最熟悉,此外只有更好地理解方法和結(jié)果,才能確定中心命題。而標(biāo)題,引言和討論的寫作都需要中心命題。我們應(yīng)該從最熟悉的事情開始,就像讀者從他們最熟悉的地方開始理解一樣。

方法/實(shí)驗(yàn)步驟

如果文章是關(guān)于新的方法、技術(shù)或算法,要非常詳細(xì)地寫它的新穎之處。要用有邏輯的、合理的方式來(lái)描述它。這會(huì)幫助讀者抓住新方法的要領(lǐng)。如果這個(gè)方法使用參數(shù),則要把每一個(gè)參數(shù)(或參數(shù)的取值)合理化,或者是以前用過(guò)的,或者可以從物理或數(shù)學(xué)推導(dǎo)出來(lái),或者通過(guò)了廣泛的測(cè)試及優(yōu)化。如果無(wú)法保證它的合理性,那就必須描述改變它會(huì)造成的影響(實(shí)際的結(jié)果應(yīng)該在結(jié)果部分或討論部分,方法部分僅包含影響的描述)。如果沒(méi)有測(cè)試它們的合理性,你應(yīng)該解釋為什么(做的代價(jià)太貴了?太費(fèi)時(shí)間了?或者需要延期到將來(lái)做)。參數(shù)改變?cè)斐傻挠绊懣梢院饬糠椒ㄊ欠馬obust。Robust的方法應(yīng)該是在參數(shù)改變很大的時(shí)候,結(jié)果也不會(huì)太大變化。

對(duì)于新方法的發(fā)展,你同樣需要設(shè)計(jì)不同的方法來(lái)測(cè)試。讓人信服就需要做盡可能多的測(cè)試。你所能找到或設(shè)計(jì)的測(cè)試越多,你的工作就越會(huì)被其他人所接受和使用。

當(dāng)完成了方法部分以后,問(wèn)一問(wèn)自己以下的問(wèn)題:1)新的術(shù)語(yǔ)是不是都定義了?2)如果你是第一次讀這部分,你能否得到重復(fù)整個(gè)工作的所有信息?記住,不要隱藏任何竅門或使用的捷徑。人們?nèi)绻荒苤貜?fù)你的結(jié)果的話就不會(huì)相信你的論文。永遠(yuǎn)不要弄虛作假!別人不是傻子,一山更比一山高,聰明的大有人在。如果你偽造數(shù)據(jù),心存僥幸不會(huì)被人發(fā)現(xiàn)。如果真的沒(méi)人發(fā)現(xiàn)的話,那就是沒(méi)有任何人想重復(fù)或使用你的結(jié)果,那只能說(shuō)明你的結(jié)果根本不值得發(fā)表,毫無(wú)意義。若要人不知,除非己莫為,這是千真萬(wàn)確的真理。

結(jié)果部分

當(dāng)你開始寫結(jié)果部分時(shí),先考慮一下結(jié)果的意義。也就是說(shuō),你理解你的結(jié)果嗎?這些結(jié)果是不是告訴了你更深刻的東西?你能從很多不同角度來(lái)理解結(jié)果嗎?你能設(shè)計(jì)證明或者反駁你的一些解釋的新測(cè)試嗎?

如果你發(fā)現(xiàn)了新現(xiàn)象,你必須證明你的結(jié)果不是你方法制造出來(lái)的(討論部分的一個(gè)好內(nèi)容)。它可以在不同的條件下重復(fù)嗎?如果你發(fā)展了一個(gè)新方法,你必須證明這個(gè)方法的重要性。它是否改進(jìn)了現(xiàn)有的方法?你的結(jié)果部分必須用不同的角度或多重測(cè)試來(lái)支持新發(fā)現(xiàn)或驗(yàn)證新方法的重要性。

一旦你對(duì)結(jié)果有更好的理解,你需要決定賣點(diǎn),也就是說(shuō)這篇文章最有意義的一個(gè)觀點(diǎn)是什么?確定這篇文章的中心命題之后要組織所有的段落來(lái)證明、支持它,用數(shù)據(jù)(有必要的話再加數(shù)據(jù))來(lái)證明它。同時(shí)也要排除其它可能性。放棄與中心命題無(wú)關(guān)的數(shù)據(jù),即使這些數(shù)據(jù)是很辛苦得來(lái)的。

標(biāo)題

當(dāng)你有了中心命題之后,就該決定文章的標(biāo)題了。標(biāo)題可以為你的方法,你的結(jié)果或結(jié)果的隱含意義做廣告。標(biāo)題是用一句話來(lái)概括你的文章。應(yīng)該把最重要,最吸引人的信息放進(jìn)標(biāo)題。比如,標(biāo)題“Stericrestrictionsinproteinfolding:analpha-helixcannotbefollowedbyacontiguousbeta-strand”主要突出了結(jié)果。另一方面,標(biāo)題“Interpretingthefoldingkineticsofhelicalproteins”突出了結(jié)果的含義。用標(biāo)題“Nativeproteinsaresurface-moltensolids:ApplicationoftheLindemanncriterionforthesolidversusliquidstate”的話,同時(shí)突出了方法和結(jié)果的含義。注意標(biāo)題“Nativeproteinsaresurface-moltensolids”是結(jié)果的解釋,而不是結(jié)果本身。用既廣泛又具體的標(biāo)題,這樣才能吸引更多的讀者。

引言部分

中心命題和標(biāo)題都決定了以后,就該寫引言了。第一件該做的事就是圍繞中心命題來(lái)收集所有相關(guān)文獻(xiàn)。搜索并研究所有最近和相關(guān)的文章(通過(guò)對(duì)中心命題關(guān)鍵字的搜索或用引用索引)。確認(rèn)你有所有最新的論文。引用所有重要的文章。如果你不引用別人的文獻(xiàn),別人也不會(huì)引用你的!如果你想誰(shuí)引用你的工作,你要先引用他的。你引用的文章越多,他們?cè)娇赡荛喿x并引用你的文章。因?yàn)槿藗兏雨P(guān)注引用他們的論文。仔細(xì)讀你所引用的文章,避免引用錯(cuò)誤。在引用上,不要偷懶。

引言的第一句最難寫,因?yàn)樗鼪Q定了你整個(gè)引言的走向。我的辦法是把第一句和文章的標(biāo)題連起來(lái)。在第一段以最基本和常見(jiàn)的術(shù)語(yǔ)來(lái)定義標(biāo)題里用的一些術(shù)語(yǔ)。從這個(gè)術(shù)語(yǔ),引入研究的領(lǐng)域和它的重要性。第二段應(yīng)該對(duì)這個(gè)研究領(lǐng)域作一個(gè)鑒定性的論述。如果中心命題是關(guān)于解決一個(gè)問(wèn)題的方法。這一段就應(yīng)該指出這個(gè)當(dāng)前研究中現(xiàn)存未解決的問(wèn)題。描述解決這個(gè)問(wèn)題的難度或挑戰(zhàn)。第三段引入你提出的辦法和它大致會(huì)帶來(lái)什么效果。你可以大略地描述你的結(jié)果和它的含義。這里有個(gè)例子。[3]

Assessingsecondarystructureassignmentsofproteinstructuresbyusingpairwisesequence-alignmentbenchmarks

Thesecondarystructureofaproteinreferstothelocalconformationofitspolypeptidebackbone.Knowingsecondarystructuresofproteinsisessentialfortheirstructureclassification,understandingfoldingdynamicsandmechanisms,anddiscoveringconservedstructural/functionalmotifs.Secondarystructureinformationisalsousefulforsequenceandmultiplesequencealignment,structurealignment,andsequencetostructurealignment(orthreading).Asaresult,predictingsecondarystructuresfromproteinsequencescontinuestobeanactivefieldofresearchfiftysixyearsafterPaulingandCoreyfirstpredicted-helixandthatthemostcommonregularpatternsofproteinbackbonesarethe-sheet.thePredictionandapplicationofproteinsecondarystructuresrelyonpriorassignmentofthesecondary-structureelementsfromagivenproteinstructurebyhumanorcomputationalmethods.

Manycomputationalmethodshavebeendevelopedtoautomatetheassignmentofsecondarystructures.ExamplesareDSSP,STRIDE,DEFINE,P-SEA,KAKSI,P-CURVE,XTLSSTR,SECSTR,SEGNO,andVoTAP.Thesemethodsarebasedoneitherthehydrogen-bondpattern,geometricfeatures,expertknowledgeortheircombinations.However,theyoftendisagreeontheirassignments.Forexample,disagreementamongDSSP,P-CURVE,andDEFINEcanbeaslargeas25%.MorebetasheetisassignedbyXTLSSTRandmorepi-helixbySECSTRthanbyDSSP.Thediscrepancyamongdifferentmethodsiscausedbynon-idealconfigurationsofhelicesandsheets.Asaresult,definingtheboundariesbetweenhelix,sheet,andcoilisproblematicalandasignificantsourceofdiscrepanciesbetweendifferentmethods.

Inconsistentassignmentofsecondarystructuresbydifferentmethodshighlightstheneedforacriterionorabenchmarkof“standard”assignmentsthatcouldbeusedtoassessandcompareassignmentmethods.Onepossibilityistousethesecondarystructuresassignedbytheauthorswhosolvedtheproteinstructures.STRIDE,infact,hasbeenoptimizedtoachievethehighestagreementwiththeauthors’annotations.However,itisnotclearwhatisthecriterionusedformanualorautomaticassignmentofsecondarystructuresbydifferentauthors.Anotherpossibilityistotreattheconsensuspredictionbyseveralmethodsasthegoldstandard.However,thereisnoobviousreasonwhyeachmethodshouldweightequallyinassigningsecondarystructuresandwhichmethodshouldbeusedinconsensus.Otherusedcriteriaincludehelix-cappingpropensity,thedeviationfromidealhelicalandsheetconfigurations,andstructuralaccuracyproducedbysequence-to-structurealignmentguidedbysecondarystructureassignment.

Inthispaper,weproposetousesequence-alignmentbenchmarksforassessingsecondarystructureassignments.Thesebenchmarksareproducedby3D-structurealignmentofstructurallyhomologousproteins.Insteadofassessingtheaccuracyofsecondary-structureassignmentdirectly,whichisnotyetfeasible,wecomparethetwoassignmentsofsecondarystructuresinstructurallyalignedpositions.Weassumethatthebestmethodshouldassignthesamesecondary-structureelementtothehighestfractionofstructurallyalignedpositions.Certainly,structurallyalignedpositionsdonotalwayshavethesamesecondarystructures.Moreover,differentstructure-alignmentmethodsdonotalwaysproducethesameresult.Nevertheless,thiscriterionprovidesameanstolocateasecondary-structureassignmentmethodthatismostconsistentwithtertiarystructurealignment.Wesuggestthatthisapproachprovidesanobjectiveevaluationofsecondarystructureassignmentmethods.

在這個(gè)例子里,標(biāo)題推薦了一個(gè)評(píng)估指派蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的方法。第一段以二級(jí)結(jié)構(gòu)的定義開始(與標(biāo)題相連)。整段描述了二級(jí)結(jié)構(gòu)的重要性。最后一句過(guò)渡到指派二級(jí)結(jié)構(gòu)的計(jì)算方法(下一段的主題)。注意“計(jì)算方法”放在句子的最后是為了強(qiáng)調(diào)而且和第二段的開始連接在起來(lái)。第二段則聚焦在計(jì)算方法中存在的問(wèn)題。舊信息“計(jì)算方法”逐漸的變到了“它們的不一致”。第三段的第一句把主題從“不一致”(舊信息)轉(zhuǎn)變成了“評(píng)估的辦法”(新信息)。然后,介紹了這個(gè)領(lǐng)域已有的工作。第四段引入新方法并討論了新方法的優(yōu)點(diǎn)。第五段(這里沒(méi)有給出)將會(huì)簡(jiǎn)要地討論結(jié)果。每一個(gè)引言應(yīng)該包括研究領(lǐng)域的介紹和意義,做這工作的具體原因,結(jié)果和隱含的意義。一般而言,讀者讀完引言,對(duì)論文的來(lái)龍去脈就應(yīng)該清清楚楚了。

討論部分

現(xiàn)在到了你寫論文的最后一部分。很多人認(rèn)為討論部分最難寫。他們常常不知道該寫什么。學(xué)生常常不能把結(jié)果從他們的解釋、含意和結(jié)論中分離出來(lái)。此外,他們不善于思考可能存在的其他解釋。好的討論通常以得到的結(jié)果和解釋的評(píng)論開始。其它可用于討論的內(nèi)容有:參數(shù)改變對(duì)結(jié)果的影響,與其他研究相比還有待解決的問(wèn)題,將來(lái)或正在進(jìn)行的工作(防止別人從事你顯而易見(jiàn)的,立刻就能實(shí)現(xiàn)的后續(xù)工作)。這里有一段文章中的討論部分。[4]

Onequestionaboutthecomplexhomopolymerphasediagrampresentedhereiswhetheritiscausedbythediscontinuousfeatureofthesquare-wellpotential.WecannotgiveadirectanswerbecausetheDMDsimulationisrequiredtoobtainwell-convergedresultsforthethermodynamics.However,thecriticalphenomenapredictedforafluidcomposedofparticlesinteractingwithasquare-wellpotentialareasrealisticasthosepredictedforafluidcomposedofparticlesinteractingwithaLJpotential.AlsoananalogouscomplexphasediagramisfoundinsimulationsofLJclusters.Thepresentresultsforsquare-wellhomopolymersmaywellbefoundinmorerealistichomopolymermodelsandeveninrealpolymers.

這一段探究了可供選擇的解釋。

摘要部分

整篇文章寫完了。你需要寫文章的摘要了。典型的摘要包括課題領(lǐng)域的重要性(回到標(biāo)題),要研究的問(wèn)題,你方法的獨(dú)特性,結(jié)果的意義和影響。這里有個(gè)例子。[3]

Howtomakeanobjectiveassignmentofsecondarystructuresbasedonaproteinstructureisanunsolvedproblem.Definingtheboundariesbetweenhelix,sheet,andcoilstructuresisarbitrary,andcommonlyacceptedstandardassignmentsdonotexist.Here,weproposeacriterionthatassessessecondary-structureassignmentbasedonthesimilarityofthesecondarystructuresassignedtostructurallyalignedresiduesinsequence-alignmentbenchmarks.Thiscriterionisusedtoranksixsecondary-structureassignmentmethods:STRIDE,DSSP,SECSTR,KAKSI,P-SEA,andSEGNOwiththreeestablishedsequence-alignmentbenchmarks(PREFAB,SABmarkandSALIGN).STRIDEandKAKSIachievecomparablesuccessratesinassigningthesamesecondarystructureelementstostructurallyalignedresiduesinthethreebenchmarks.Theirsuccessratesarebetween1-4%higherthanthoseoftheotherfourmethods.TheconsensusofSTRIDE,KAKSI,SECSTR,andP-SEA,calledSKSP,improvesassignmentsoverthebestsinglemethodineachbenchmarkbyanadditional1%.Theseresultssupporttheusefulnessofthesequencealignmentbenchmarksasthebenchmarksforsecondarystructureassignment.

前兩句陳述了問(wèn)題。第三句提出了解決辦法。這些句子后面跟著結(jié)果。整個(gè)摘要以總結(jié)收尾。注意摘要里的主體部分是結(jié)果及其意義和影響。

總結(jié)

1.認(rèn)真對(duì)待寫作。盡你最大努力花時(shí)間寫作。它是科學(xué)研究的重要一環(huán)。文章沒(méi)寫好,沒(méi)人看,沒(méi)人用,等于沒(méi)發(fā)表。

2.除非這個(gè)研究是全面徹底的,而且你試了所有可以支持你結(jié)論的方法,否則不要去發(fā)表。

3.重新思考,并合理解釋為什么做這項(xiàng)工作,做了什么,什么是最重要的發(fā)現(xiàn)?為什么用這個(gè)方法?為什么用這些參數(shù)?什么是以前做過(guò)的(更新文獻(xiàn)搜索)?不同在什么地方?

4.要從批判的角度來(lái)看你的工作,想一想別人會(huì)怎樣來(lái)挑毛病。只有這樣,才能找到弱點(diǎn),進(jìn)一步發(fā)展。我的許多論文是在反復(fù)討論中大幅度修改,許多計(jì)算經(jīng)常要重做。只有理順和理解結(jié)果,文章才會(huì)更有意義。

5.要能回答所有合理的質(zhì)疑。如果你自己有疑問(wèn),一定要搞清楚,否則別人又怎會(huì)相信。不要輕易相信得到的革命性發(fā)現(xiàn)。

6.以高標(biāo)準(zhǔn)嚴(yán)要求寫論文,不與爛文章比,爭(zhēng)取建立自己的品牌。不要隱藏任何事實(shí),不作假,不要低估其他科學(xué)家的智慧。讓你的研究可重復(fù)。把所有的材料和數(shù)據(jù)上網(wǎng)。

7.從頭(標(biāo)題)到尾(結(jié)論或討論)要從舊信息過(guò)渡到新信息。永遠(yuǎn)不要在句子的開頭引入新信息。切忌在術(shù)語(yǔ)被定義之前使用它們。

8.照抄別人文章里的句子是不道德的。這暴露出作者不愿思考,只走捷徑,不是一個(gè)真正科學(xué)家的料。同時(shí)抄來(lái)的句子常常會(huì)打斷文章中原有信息的流通,不利讀者對(duì)文章的理解。一定需要用別人的原句,就必須用上引號(hào),并引用該文獻(xiàn)。

9.在段首要有闡明整段主題的句子,在段尾要有連到下段的過(guò)渡句。從標(biāo)題到結(jié)論都要連貫。句句相扣,段段相連,讓一篇論文是一個(gè)整體而不是雜亂無(wú)章地把句子堆積在一起。這樣才能使讀者享受閱讀你的文章。

10.寫,重寫,再重寫。沒(méi)有人能第一次就寫好。不花時(shí)間,不下功夫,寫不好。我的文章一般要修改十次以上。

結(jié)束語(yǔ)

寫科技論文不能像寫散文,想到哪里就寫到哪里。好的論文就像一部好的小說(shuō)一樣,需要構(gòu)思策劃,情節(jié)要一環(huán)扣一環(huán),而結(jié)局是令人意外的。當(dāng)然這一切,前提是你必須有令人激動(dòng)的結(jié)果。這篇短文的目的是在有較好結(jié)果的基礎(chǔ)上,怎樣更好地實(shí)事求是地宣傳你的結(jié)果。主要方法是使文章簡(jiǎn)單易懂,條理清楚,同時(shí)又全面深刻,令人信服。我反對(duì)虛假的包裝,夸張的描述,這樣往往適得其反。事實(shí)上,科技論文要避免用帶有情感的形容詞像Exciting或Remarkable來(lái)描述你的結(jié)果。也就是說(shuō)要通過(guò)結(jié)果的描述來(lái)使讀者體會(huì)到“Exciting”或“Remarkable”,讓事實(shí)來(lái)說(shuō)話。正如說(shuō)笑話的人自己不笑會(huì)更有效果。

致謝

此文中的一些例子出自“TheScienceofScientificWriting”byG.D.GopenandJ.A.Swan,AmericanScientist,78,550-558,1990.我在杜克大學(xué)Gopen教授1995年年度短訓(xùn)班受益非淺。我要特別感謝我的導(dǎo)師MartinKarplus(哈佛大學(xué)),GeorgeStell(紐約州立大學(xué)-石溪校區(qū)),HaroldL.Friedman(紐約州立大學(xué)-石溪校區(qū))和CarolHall(北卡羅來(lái)納州立大學(xué))的鼓勵(lì)和指導(dǎo)。沒(méi)有他們,我不會(huì)有那么多機(jī)會(huì)練習(xí)英文寫作。最后,我要感謝我的學(xué)生和博士后。他們對(duì)科學(xué)的貢獻(xiàn)使我可以繼續(xù)寫論文,基金申請(qǐng),或評(píng)論。此文中的一部分例子來(lái)自與他們合作的文章。此文初稿是用英文寫的。由于我的中文打字速度太慢,特別感謝徐貝思幫我翻譯成中文初稿。如果有不妥的地方是我的問(wèn)題,請(qǐng)多指教。此文在網(wǎng)上出現(xiàn)以后,得到不少關(guān)注。特別感謝趙立平教授的建議及感謝許多校友和網(wǎng)友的指正和鼓勵(lì)。

引用:

[1]G.D.GopenandJ.A.Swan,AmericanScientist,78,550-558(1990)

[2]H.ZhouandY.Zhou,Bioinformatics21,3615--3621(2005).

[3]W.Zhang,K.Dunker,andY.Zhou,Proteins,inpress(2007).

[4]Y.Zhou,C.K.Hall,andM.Karplus,Phys.Rev.Lett.77,2822(1996).